SARS疫情發生時，花蓮慈濟醫學中心結合院內病毒實驗室與合心實驗室資源，使用分子醫學檢測SARS病毒，不僅做為院內專家小組審查依據，也將資源與東部醫療院所共享。目前，衛生署在台灣分北、中、南、東四個區域，建立十家SARS病毒檢驗合約實驗室，東部由花蓮慈院承擔，其檢驗能力，也經衛生署疾病管制出題「盲測」，全數答對。最重要的是，東部通報病例檢驗，不必遠送台北，但能迅速掌握檢驗報告，做為診斷參考。

慈濟醫學中心毒物科主任陳立光指出，東部檢體不用千里迢迢送至北部，除省掉等待檢驗的時間之外，檢驗報告可以快速出爐，提供醫師可靠的診斷依據，進行治療，也可以縮短排除病例的時間、提早解除居家隔離者警戒，還可節省醫療資源、迅速掌握疫情。

進行檢測時，全省十家合約實驗室的責任醫院，九家採取比測評鑑，也就是，將患者檢體，同時於醫院與疾病管制局檢驗，結果相符者，評鑑即予通過。但東部病例不多，檢體多是陰性，若採取比測方式，勢必無法產生正確性。為解決東部病例數不多的問題，疾病管制局特別出題考試，採用「盲測」，檢驗花蓮慈濟醫學中心的能力。

為求準確性，避免北部送花蓮的長途路程，影響病毒轉變，造成檢測誤差，也展現花蓮慈院病毒實驗室的能力，陳立光先於北部將病毒RNA取出，轉成較為穩定的c-DNA，再帶回花蓮檢驗，結果揭曉，六隻病毒全部正確，為全國第一家通過「盲測」的醫院，讓衛生署更放心託付「防煞」的重責大任。

目前，SARS病毒檢驗工作是由慈濟醫學中心檢驗科擔綱，主任林等義指出，檢驗SARS冠狀病毒方法很多，衛生署合約要求醫院必須採分子檢測法的RT-PCR或real-time RT-PCR，慈濟醫學中心兼具兩種檢測方式的能力，且準確度相同，故採用檢測時間較短的real-time RT-PCR檢測。

一般而言，醫院收到檢體後，三十六小時之內，可以完成檢驗報告，但花蓮慈院更進一步，收到東部各院送來檢體，雖以喉頭試紙、肛門試紙為主，但若提供血液，也有能力承擔，且於上午八時之前收到，當天下午五時，不到十個小時，即可見到結果，同時，將檢驗報告傳送地方衛生主管機關與送檢單位，共同為防疫工作「加分」。