非典型肺炎造成國內民眾憂慮，但東部求醫患者與往常無異，不似北部各大醫院求診患者紛紛戴上口罩，而花蓮慈濟醫學中心已做好應變措施，也籲請民眾不要緊張，若有類似患者就醫，醫院將立即採取第三級防護措施，於負壓式隔離病房照護患者，守護患者生命及防止傳染危險。

感染症最令人擔心的是院內感染管制能否落實，慈濟醫學中心表示，非典型肺炎主要經由飛沫傳染•常見的病原體包含肺黴漿菌、退伍軍人症、病毒、披衣菌等，日前，慈濟醫學中心感染管制小組人員接獲疾病管制局發布通知後，已著手蒐集詳細資料，並將資料傳送給醫院所有人員，提醒照護患者時應保持警覺。

花蓮慈濟醫學中心感染管制小組發布訊息指出，醫護人員一旦收治嚴重急性呼吸道症候群患者，照護時應落實分級防護措施，採用第三級防護，其等級較開放性肺結核高，醫護人員需穿戴隔離衣、隔離帽，也要戴上醫療防護級口罩、手套，且將患者安置於隔離病房。

去年，慈濟醫學中心成立呼吸道感染隔離病房，並通過衛生署評鑑，提供五間隔離病房，內科加護病房則有四間，外科加護病房有兩間隔離病房，皆為完備的急重症隔離病房，採負壓式設計，空氣只能進不能出。

若醫院收治疑似個案，輕症患者將送呼吸道感染隔離病房，重症患者送加護病房的隔離病床，在此同時，醫護人員將於第一時間，通知院內感染管制小組，且不分日夜，依急性呼吸道症候群通報疾病管制局。